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复合糖作为糖类与蛋白质或者脂质结合的产物,在生物中分布广泛,具有重要的功能.GLYCAN数据库收录了实验验证过的复合糖的信息,主要是结构信息。每条记录用G数字标识,比如<代码> G00197>
对于复合糖而言,搞清楚其结构只是最基础的研究,我们更加关注其在生命活动中的意义.kegg将复合糖相关的基因,代谢途径,疾病等信息关联在一起,通过通路的形式进行展示。在通路数据库中,有1个类别,专门用于描述复合糖的代谢通路信息,叫做<代码>多糖生物合成和metaboli ,
在这些途径中,主要展示的信息是复合糖的代谢途径,与基因的相互作用等信息,有部分图中还包含了复合糖对应的生物合成途径,或者降解途径,这部分信息成为结构地图。比如<代码> map00510> 代谢通路 结构映射 对于复合糖在癌症中的作用,专门有1个途径来记录这些信息 http://www.kegg.jp/kegg-bin/show_pathway?hsa05205 糖基转移酶催化糖类与蛋白,脂质等物质的结合。 对于所有收录的糖基转移酶的分类,对应闪亮数据库中的链接如下 多糖数据库收录了糖类物质的结构信息,并给出了糖类参数的各种代谢通路。 糖基转移酶,催化糖类与蛋白质、脂质等的结合,在KO数据库中给出了对应的信息。 关于KEGG多糖数据库的原理是什么就分享到这里了,希望以上内容可以对大家有一定的帮助,可以学到更多知识。如果觉得文章不错,可以把它分享出去让更多的人看的到。
有关糖基转移酶的信息,在KO数据库中进行了存储,比如下图,不仅给出了对应的基因,还给出了对应的酶EC编号,CAzy数据库的信息,而且还给出了参与的通路信息。
http://www.kegg.jp/kegg-bin/get_htext?ko01003.keg
总结
KEGG多糖数据库的原理是什么
